根据规划，实验区将重点发展高新技术产业、商贸加工、海洋产业、旅游养生和现代服务业。

　　这是平潭综合实验区总体发展规划编制完成后，第一次透露出来的有关总规的信息。
   
　　开发建设“三步走”

　　平潭综合实验区总体发展规划的期限至2030年，将分三阶段开发建设。

　　开发起步阶段：2009年~2012年。重点加快平潭海峡一桥（含复桥）、渔（溪）平（潭）高速公路、平潭环岛公路、客货滚装码头等基础设施和城市污水处理、垃圾处理、度假酒店及旅游景点配套设施建设；加快前期工作步伐，争取早日动工建设平潭海峡二桥、长乐古槐至平潭的长（乐）平（潭）高速、福（州）平（潭）高铁延伸平潭上岛线等重大基础设施工程。

　　开发起步期内，基础设施显著改善，全方位开放开发的基础设施框架初步形成；两岸合作的特色产业开始起步，生态环境质量及公共服务明显改善。

　　全面开发阶段：2013年~2020年。力争“十二五”末，平潭海峡二桥及长平高速、福平高铁等交通通道、岛外调水工程基本建成，主岛海坛岛的供水、供电等配套基础设施更加完善。这一时期，两岸经济融合进一步深化，探索两岸合作新模式的示范效应充分显现；以高新科技和现代服务业为主导，布局合理、协调发展、具有特色的两岸合作产业体系基本形成；商务文教、港口经贸、旅游休闲等功能区基本形成，公共服务水平显著提高，现代化的新兴海岛城市粗具雏形。

　　发展完善阶段：2021年~2030年。经过近20年的努力，两岸经济全面对接、文化深度交流、社会生活高度融合，主要经济社会发展指标达到我国沿海发达地区先进水平；商务文教、港口经贸、旅游休闲区功能更加完善，低碳科技区基本成型；交通便捷、配套设施先进、生态良好、生活舒适的两岸人民共同家园和生态宜居岛基本建成。