据有关负责人介绍，总体来看，新增建设用地土地有偿使用费和耕地开垦费征收较好，但存在用于农业开发的土地出让收入计提差距较大，复垦费免或减征严重、开垦费征收标准低等突出问题。调查发现，有三省2006年实际计提农业土地开发资金仅占应计提额度的7%至35%。与此同时，资金使用不足，滞留较多。某省近两年土地各项专项资金支出占征收总额的六成，结余资金约20亿元。

　　《通知》要求，省级政府授权市区的市(州)批准农用地转用、涉及缴纳新增建设用地土地有偿使用费的，要依照有关法规严格执行；土地复垦费则要结合本地实际，积极研究制订土地复垦费的征收办法和标准，并会同有关部门研究落实土地出让收入用于农业土地开发资金办法，足额计提，确保各项费用足额征收，按照规定用途专项使用。

　　省级国土资源部门要抓紧制订本省(区、市)新增费分配使用办法，并报国土财政两部门备案。省级国土资源部门要做好本地区新增费稽查办法的制订和备案工作。进一步加强2006年底实施的国家投资项目的实施管理。全部项目原则上应于2009年底前竣工验收。

　　各省(区、市)各类土地整理复垦开发项目均需动态备案，不备案的，其增加耕地不能计入完成的补充耕地任务，不能用于占补平衡，不予核定和下拨中央分成新增建设用地土地有偿使用费。

　　各级国土资源部门要在报批建设用地时，把好专项资金征收关，在依法足额缴纳相关费用后，方可办理用地批准文件；各类非农建设经依法批准占用耕地后，经耕地保护责任目标考核，完成补充耕地计划的，在资金项目安排上予以倾斜。