与普通公寓相比，独栋别墅这样的纯别墅项目买卖需缴纳的税费要高的多。
买方应付的契税为3%；卖方税费除按规定支付税费外，还要额外支付综合税。综合税有以下2种征收方法，纳税人可以任选其一来缴税：
第一种为收取房屋出售价格之5%；
第二种为一卖出价与买进价价差，征收营业税及营业税附加税、土地增值税和个人所得税，在房产市场中被简称为“按差价征收三税”，三税之和约为差价的30%-70%不等。
综合税在各地有不同的征收方法，即使同是按总价或差价征税的区之间，税率也不完全相同，置业者在交易前可到物业所在区的房地产交易中心咨询。