建设部副部长齐骥日前在全国房地产市场秩序专项整治城市经验交流现场会上表示，当前房地产企业存在问题最多的是预售销售环节，其次为缴纳税费、土地取得和规划审批环节；各级主管部门存在的主要问题是在征地开发、房屋建设过程中向征地、开发企业乱收费。
尽管房地产市场秩序专项整治工作有序推进，取得了很多成功经验和初步成效，但专项整治工作中仍然存在一些不足和问题。
一是部分企业和主管部门对自身的不规范行为隐瞒不报，整改不及时。如某省11个地级城市的1200多个项目在自查阶段没有暴露出一个问题，但在全面检查中却被查出有20％的项目存在不同程度的违法违规问题。
二是一些城市没有严格按照要求对项目进行自查和检查。有的以抽查代替全面检查，有的仅对2006年的在建项目进行检查，还有的只对项目的交易环节进行检查。
三是有的地区查办案件力度不够，该查的不查，该曝光的不敢曝光；对待群众的投诉举报，推诿应付，敷衍塞责；对于违法违规项目的处罚避重就轻，以罚代拆，不能有效地遏制开发商的违规行为的蔓延。